群発頭痛は今だ解明されていず諸説がある。

１） 視床下部 generator 起源説　同じ時間に生じることから

２） ニュー ロペプチド変化より三叉神経血管説

３） 内頸動脈周囲起源説

４） 三叉神経過剰興奮が副交感神経活性化説など。最近、この三叉神経興奮が 上唾液核に達して，翼口蓋神経節から頭蓋内の大血管や涙腺・鼻粘膜にいたる副交感神経系が興奮し自律神経症 状を呈すると考えられている。