群発頭痛は1,000人に1人と比較的稀な為、正しく診断つくまで数年以上かかる場合が多く見られます。

発作にはイミグラン皮下注射が有効ですが、非ステロイド系消炎鎮痛剤は無効の事が多い。

期間や程度を改善する予防にはベラパミルがよく使われるが、バルプロ酸、プレドニン、ロラタジン、トピラマートなどを用いることもあります。